Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EBF4Q9BQW3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EBF4Q9BQW3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms