Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLF1Q9BQI6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF1Q9BQI6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms