Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMCHL2Q9BQD1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMCHL2Q9BQD1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms