Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRBNQ96SW2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CRBNQ96SW2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms