Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSPAN18Q96SJ8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN18Q96SJ8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN18Q96SJ8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms