Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRAMP1Q96RY5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms