Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX1Q96RV3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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