Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf85Q96MD7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms