Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRRC1Q96M27 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRRC1Q96M27 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms