Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C12orf42Q96LP6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf42Q96LP6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms