Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00208Q96KT6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms