Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR1Q96JP9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR1Q96JP9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR1Q96JP9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR1Q96JP9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR1Q96JP9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDHR1Q96JP9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDHR1Q96JP9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDHR1Q96JP9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms