Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPD52L3Q96J77 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPD52L3Q96J77 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms