Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZC2HC1AQ96GY0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZC2HC1AQ96GY0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms