Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYFIP2Q96F07 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYFIP2Q96F07 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms