Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAVIN3Q969G5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAVIN3Q969G5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms