Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM58Q8NG06 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM58Q8NG06 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms