Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH13Q8NBN7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RDH13Q8NBN7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms