Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC63Q8NA47 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC63Q8NA47 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms