Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RTL3Q8N8U3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTL3Q8N8U3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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