Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRC18Q8N456 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC18Q8N456 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms