Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00518Q8N0U6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00518Q8N0U6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms