Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP3Q8IZU3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms