Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMYD4Q8IYR2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMYD4Q8IYR2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms