Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKL3Q8IVW4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms