Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC190Q86UF4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC190Q86UF4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms