Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01551Q86U37 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms