Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC11Q7Z392 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms