Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDXQ7Z353 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms