Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DIPQ5VU43 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4DIPQ5VU43 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms