Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SAMD5Q5TGI4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD5Q5TGI4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms