Protein–RNA interactions for Protein: Q5T870

PRR9, Proline-rich protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR9Q5T870 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRR9Q5T870 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR9Q5T870 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms