Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM47AQ5JRC9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM47AQ5JRC9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms