Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT3Q5FWE3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT3Q5FWE3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT3Q5FWE3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT3Q5FWE3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT3Q5FWE3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT3Q5FWE3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT3Q5FWE3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRRT3Q5FWE3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRT3Q5FWE3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms