Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCAF6Q58WW2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms