Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4orf46Q504U0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms