Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPRNQ4KMQ1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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