Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LSM12Q3MHD2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms