Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HFEQ30201 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HFEQ30201 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HFEQ30201 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HFEQ30201 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HFEQ30201 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HFEQ30201 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HFEQ30201 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HFEQ30201 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HFEQ30201 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HFEQ30201 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HFEQ30201 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HFEQ30201 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HFEQ30201 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HFEQ30201 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HFEQ30201 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HFEQ30201 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HFEQ30201 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HFEQ30201 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HFEQ30201 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HFEQ30201 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HFEQ30201 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HFEQ30201 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms