Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSR1Q2NL82 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSR1Q2NL82 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms