Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDO1Q16878 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDO1Q16878 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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