Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STX1AQ16623 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX1AQ16623 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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