Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACKR1Q16570 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACKR1Q16570 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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