Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAB35Q15286 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB35Q15286 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms