Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HERC3Q15034 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HERC3Q15034 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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