Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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ODF1Q14990 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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ODF1Q14990 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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ODF1Q14990 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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