Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDC1Q14676 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms