Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL9A2Q14055 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COL9A2Q14055 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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