Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH18Q13634 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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CDH18Q13634 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH18Q13634 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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