Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GPS1Q13098 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPS1Q13098 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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